Instituudi kõrgeim akadeemiline otsustuskogu on instituudi nõukogu, kes kehtestab instituudi tegevuskava, määrab
arenguprioriteedid ning arutab ja otsustab instituudi õppe- ning teadus- ja arendustööd puudutavaid küsimusi.
Karin Kogermann, professor, instituudi juhataja, nõukogu esimees
Jyrki Heinämäki, professor, farmaatsia doktoriõppe programmijuht
Daisy Volmer, kaasprofessor, proviisoriõppe programmijuht
Ott Laius, Ravimiamet
Marika Saar, SA TÜ Kliinikum, Eesti Haiglaapteekrite Selts
Ülle Rebane, Eesti Apteekrite Liit
Tanel Kuusmann, Tamro Eesti OÜ
Linda Maria Laane
Hanna Marta Nellis
Laura Liisa Rikkand
Saskia Täpsi
Ain Raal, professor
Urve Paaver, kaasprofessor
Ivo Laidmäe, kaasprofessor
Andres Meos, kaasprofessor
Andres Lust, lektor, teadur
Kristiina Sepp, nooremlektor
Nõukogu sekretär: Shandi Sikk
Tutvu farmaatsia instituudi nõukogu kodukorraga kodukorraga.